95年行政院核定東沙環礁國家公園計畫時，交議「建議應優先辦理資源復育、監測與生態研究等工作，並訂定珊瑚礁存活率等相關復育措施之考核指標，俟指標顯示復育措施已達到一定成果後，方考慮推動後續之生態旅遊環境教育工作。」所以96年東沙環礁公園成立以後，海管處請中山大學的陳陽益教授於95年研究東沙海域環境調查及規劃-水文、測站、內波觀測，及96年至97年間東沙環礁國家公園海域環境調查及測站評估，及97年東沙內環礁海域海流、水深與棲地調查。基於以上條件，海委會將持續與各部會進行相關研究與調查，以為永續東沙生態旅遊之環境監測推動之依據。